突破!江西省林科院油茶科技創新團隊破譯紅花油茶“密碼”
近日,江西省林科院油茶團隊聯合南京林業大學曹福亮院士創新團隊在國際頂級學術期刊《園藝研究》在線發表了研究論文。論文成果在全球范圍首次破譯了紅花油茶遺傳密碼,是目前全球質量最高的染色體級別油茶基因組,期刊編審認為本論文成果具有跨時代的里程碑意義。
油茶是全球四大油用樹種之一,一般是指山茶屬植物中種子含油量高的多種油茶樹的總稱。油茶籽油(山茶油)富含不飽和脂肪酸和多種有益于人類健康的次級代謝物,被稱為“東方橄欖油”。油茶基因組較大且主栽品種常為多倍體,對重要經濟性狀的形成及分子調控機制缺乏分子生物學基礎平臺,限制了分子育種進程,亟待可參考的基因組信息。紅花油茶作為我國油茶主栽種之一,表現為高籽油率、高油酸及油脂富含角鯊烯等三萜化合物;尤其具有“春華秋實”的花果不同期生殖特征和穩定二倍體(2n=30)、雜合度相對較低(1.75%)的遺傳特點,是油茶研究的理想模式種。
據了解,該研究利用三代測序技術PacBio?HiFi并輔助Hi-C染色體構象捕獲技術全球首次成功獲得了紅花油茶高質量染色體級別基因組,組裝基因組2.73?Gb,scaffold?N50高達185.30?Mb;紅花油茶基因組中重復序列約2.16?Gb,占基因組的79.09%;結合從頭預測、同源蛋白信息以及轉錄組數據共注釋了64608個高可信度基因。同時,研究較為系統地繪制了山茶油不飽和脂肪酸與三萜類活性成分的生物合成途徑及其基因簇,發現紅花油茶基因組中三萜類生物合成的基因家族發生了顯著性擴張,其萜烯合成酶基因成簇分布。該研究工作為山茶屬基因組的適應性進化與油茶籽油脂代謝提供了新的見解,為油茶遺傳改良奠定了重要的理論基礎。
江西省林科院溫強研究員為論文第一通訊作者,南京林業大學曹福亮院士和徐立安教授分列二、三通訊作者。論文共同第一作者有南京林業大學胥猛教授、江西省林科院黃彬博士及南京林業大學碩士畢業生申騰飛。江西省林科院龔春研究員、南京林業大學倪州獻講師以及周鵬燕博士生也參與了本研究。本研究相關工作得到國家自然科學基金、江西省重點研發計劃、江西省自然科學基金等項目的資助。
(圖片由江西省林業科學院提供)
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