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研究發(fā)現(xiàn)人們對數(shù)千種人類蛋白質(zhì)幾乎一無所知


(資料圖片)

一個被稱為unknome的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫根據(jù)人們對蛋白質(zhì)的了解程度對蛋白質(zhì)進行排名,結(jié)果顯示,人們對數(shù)千種人類蛋白質(zhì)幾乎一無所知,而其中一些蛋白質(zhì)對生存至關(guān)重要。8月8日,相關(guān)成果發(fā)表于《科學(xué)公共圖書館—生物學(xué)》。

為了創(chuàng)造unknome數(shù)據(jù)庫,英國劍橋大學(xué)MRC分子生物學(xué)實驗室的Sean Munro和同事從人類身上發(fā)現(xiàn)的大約2萬個蛋白質(zhì)基因入手。他們將密切相關(guān)的、可能具有相似功能的人類基因或蛋白質(zhì)組合在一起,產(chǎn)生了大約7500個蛋白質(zhì)簇。

接下來,他們將在老鼠或果蠅等常見研究動物中發(fā)現(xiàn)的密切相關(guān)的蛋白質(zhì)添加到這些蛋白質(zhì)簇中,因為這些蛋白質(zhì)可能也具有相同功能。然后,他們根據(jù)基因功能主要信息庫中的條目數(shù)量,給每個蛋白質(zhì)簇打分。

一種沒有被直接研究過的人類蛋白質(zhì),如果其在另一種動物身上的等效蛋白質(zhì)得到了充分研究,它的得分仍然很高。如果蛋白質(zhì)在被認為更可靠的條目中出現(xiàn)也會得到更高的分數(shù),比如發(fā)表在期刊上。 Munro坦言,這種評分有些武斷,但在試圖弄清人們未知的東西時,這是不可避免的。

一些蛋白質(zhì)被研究得十分透徹,因此其得分遠遠超過100。例如,一種參與胚胎發(fā)育的名為音猬因子的蛋白質(zhì)得分為168,而幫助阻止細胞癌變的蛋白質(zhì)p53得分為126。然而,仍有超過2200種蛋白質(zhì)的得分低于2、1100種低于1、超過800種為0。

理論上,這些得分低的蛋白質(zhì)可能沒有被研究過,因為它們沒有任何重要的作用。為了解這些蛋白質(zhì)是否重要,研究小組使用了一種名為RNA干擾的技術(shù),降低果蠅中260種得分低于1的蛋白質(zhì)的水平。在60個案例中,果蠅死亡,這表明這些特殊的蛋白質(zhì)具有重要的功能。

Munro說,這對研究果蠅的團隊成員來說是一個很大的驚喜。“他們只是假設(shè)已經(jīng)找到了所有可能的重要基因,事實證明并非如此。”

他說,未知蛋白質(zhì)的數(shù)量正在慢慢減少,但他希望加快發(fā)現(xiàn)的步伐。目前的問題是,資助機構(gòu)和研究人員都不愿意冒險研究未知蛋白質(zhì),因為他們擔(dān)心相關(guān)的研究工作無足輕重從而無回報。

“甚至可能有我們不知道的生物過程,但沒有人在尋找與這一過程有關(guān)的蛋白質(zhì),因為沒有人知道它們。”Munro說,這聽起來可能令人驚訝,但被稱為CRISPR的基因編輯技術(shù)是基于細菌蛋白質(zhì)的,后者的功能直到2012年才被發(fā)現(xiàn)。

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